Тимофеев Илья Вячеславович

Тимофеев Илья Вячеславович
Timofeev Ilya Vyacheslavovich

Младший научный сотрудник лаборатории биотехнологии и физиологии фототрофных организмов

e-mail: timofeew.g2001@yandex.ru
ORCID: 0000-0002-5862-2203

Ведущее научное направление: Структурно-функциональная организация и биохимия гидрогеназ

Профиль исследования Ильи Вячеславовича Тимофеева: сфокусирован на физиологической роли и свойствах HydSL-гидрогеназы пурпурной серной бактерии Thiocapsa bogorovii. Центральный объект — HydSL-сульфгидрогеназный комплекс, предположительно сопрягающий окисление молекулярного водорода с восстановлением элементарной серы до сероводорода. Цель работы — установить вклад комплекса в серный метаболизм фототрофных бактерий и охарактеризовать его как редокс-систему переноса электронов от H₂ к S⁰. Экспериментальная стратегия включает управляемое культивирование T. bogorovii при 30 °C и фиксированной освещённости с варьированием газовой фазы (H₂, Ar, строгая анаэробиоза) для оценки влияния водорода на рост и проявление HydSL-активности. Аналитические показатели: динамика биомассы, содержание бактериохлорофилла и удельная гидрогеназная активность по поглощению H₂ с метилвиологеном как функциональный маркёр экспрессии HydSL. Ожидаемые результаты включают определение субъединичного состава и редокс-партнёров комплекса, уточнение спектральных характеристик кофакторов и разработку условий нативной стабилизации/выделения. Полученные данные будут интерпретированы в контексте энергетики фототрофной клетки и перераспределения электронного потока при серном метаболизме, с перспективой применения в биокаталитических процессах водородной энергетики.

Научные интересы:

1. Физиологическая роль HydSL-гидрогеназы и HydSL-ассоциированного сульфгидрогеназного комплекса в серном метаболизме фототрофных бактерий (Thiocapsa bogorovii).
2. Редокс-биохимия и механизмы переноса электронов от H₂ к серным акцепторам (S⁰ и связанные формы) с участием металлосодержащих кофакторов.
3. Регуляция и функциональная экспрессия hydSL в зависимости от условий культивирования и газовой фазы (H₂/Ar/строгая анаэробиоза).
4. Стабилизация и нативная изоляция гидрогеназных комплексов как база для последующих биокаталитических применений.
5. Экологическое состояние окружающей среды и оценка воздействия антропогенного вляния на природные экосистемы
6. Общественное здравоохранение, охрана окружающей среды и охрана труда

Методы и инструменты:

1. Управляемое фототрофное культивирование T. bogorovii (контроль температуры, освещённости, газовой фазы).
2. Анаэробная техника: продувка инертными/реакционными газами (Ar, H₂), герметизация, минимизация контакта с O₂.
3. Оценка роста: оптическая плотность/клеточная концентрация, построение кривых роста, расчёт μ и выходов биомассы.
4. Определение бактериохлорофилла (экстракция, спектрофотометрия, расчёт концентрации по коэффициентам).
5. Энзимологические тесты: измерение H₂-поглощающей гидрогеназной активности с искусственным акцептором (метилвиологен), расчёт удельной активности.
6. Подготовка белковых проб (лизис, фракционирование, осветление/центрифугирование), оценка белка (при необходимости — совместимые методы).
7. Нативный электрофорез/гель-анализ белковых комплексов (если применимо в лаборатории) и оценка субъединичного состава.
8. УФ-видимая спектроскопия для мониторинга пигментов и (при наличии подходов) косвенной оценки редокс-состояний/кофакторных групп.
9. Базовая статистическая обработка экспериментальных данных.

Основные задачи:

1. Сопоставить рост T. bogorovii при культивировании в атмосфере H₂, Ar и при строгой анаэробиозе без газовой фазы, определить различия кинетики и выходов биомассы.
2. Оценить, как состав газовой фазы влияет на уровень HydSL-ассоциированной гидрогеназной активности (H₂-поглощение) как функциональный маркёр экспрессии hydSL.
3. Установить связи между ростом, перестройкой фотосинтетического аппарата (по бактериохлорофиллу) и уровнем гидрогеназной активности в динамике культивирования.
4. Определить условия, при которых максимизируется проявление HydSL-зависимого фенотипа (индукция активности), и сформулировать воспроизводимый режим культивирования.
5. Разработать и оптимизировать протоколы стабилизации/получения нативных белковых фракций HydSL-комплекса для дальнейшей характеристики.
6. Сформировать экспериментальные критерии, позволяющие связать наблюдаемую HydSL-активность с участием комплекса в H₂-зависимом восстановлении серы (постановка дальнейших проверок).

Научная результативность

2026 год

Статьи в научных журналах:

1. Makhmadyusuf Khasimov, Ekaterina P. Petushkova , Ekaterina V. Mayorova, Ilya V. Timofeev, Natalia N. Rudenko, Anatoly A. Tsygankov., Hydsl hydrogenase of thiocapsa bogorovii may participate in sulfur respiration. Biochimica et Biophysica Acta — Bioenergetics (2026) 1867(2)
   https://doi.org/10.1016/j.bbabio.2026.149585 Q1

Патенты и регистрация ЭВМ:

1. База данных «Изображения гистологического материала рака шейки матки» №2026620060
   Дата регистрации: 13.01.2026 г.
   Тимофеев Илья Вячеславович, Затула Милена Алексеевна, Москалёва Елизавета Александровна, Иванова Наталья Владимировна, Мальцев Павел Николаевич, Войку Иван Петрович

2025 год

Статьи в научных журналах:

1. Иванова Н. В., Тимофеев И. В., Наседкин А. Г. Возможности использования искусственного интеллекта в патогистологической диагностике и в подготовке студентов медицинских ВУЗов // Виртуальные технологии в медицине. — 2025. — № 3. — С. 196–197.
   https://doi.org/10.46594/2687-0037_2025_3_2016
2. Современные аспекты формирования профессиональной коммуникативной культуры студента-медика / М. Ю. Галактионова, Н. В. Тихонова, А. О. Сабанова, Иванова Н.В., Тимофеев И.В. // Медицинское образование и профессиональное развитие. — 2025. — Т. 16, № 1. — С. 41–48.
   https://doi.org/10.33029/2220-8453-2025-16-1-41-48
   

Тезисы докладов на конференциях:

1. Тимофеев И. В., Никольская Л. В. Проектирование полуавтономного курса для совершенствования навыков химического анализа у студентов естественно-научного образования и школьников профильных классов с помощью гибких технологий обучения // Педагогическая инноватика и непрерывное образование в XXI веке : сборник научных трудов III Международной научно-практической конференции : в 4 ч. Ч. 3. Дополнительное образование детей и взрослых / редколлегия : Н. В. Шабалин (гл. ред.), М. С. Суханова,. — Министерство сельского хозяйства РФ, ФГБОУ ВО Вятский ГАТУ Киров: 2025. — С. 99–103.

Патенты и регистрация ЭВМ:

1. Программное обеспечение «OncoFocus 2.0» №2025695651
   Дата регистрации: 12.12.2025 г.
   Демичев Василий Анатольевич, Мальцев Павел Николаевич, Тимофеев Илья Вячеславович

2024 год

Статьи в научных журналах:

1. Тимофеев И. В., Никольская Л. В. Комплексный мониторинг качества воды устья реки Великой (Псковская область) по ряду гидрохимических и гидробиологических показателей // Самарский научный вестник. — 2024. — Т. 13, № 2. — С. 81–87.
   https://doi.org/10.55355/snv2024132109
2. Галактионова М. Ю., Колесникова Н. Е., Тимофеев И. В. Особенности развития детей, часто болеющих респираторными заболеваниями // Azerbaijan pediatrics journal. — 2024. — Т. 4, № 1. — С. 71.
3. Тимофеев И. В., Галактионова М. Ю. Особенности формирования коммуникативных навыков у студентов-медиков // Российский педиатрический журнал. — 2024. — Т. 27. — С. 52–52.
   EDN: yojysk
4. Барышникова А. К., Тимофеев И. В. Показатели здоровья и адаптационный потенциал первоклассников // Российский педиатрический журнал. — 2024. — Т. 27. — С. 1S.
   EDN: csjxcc

Тезисы докладов на конференциях:

1. Тимофеев И. В., Баронова Е. И., Никольская Л. В. Характеристика содержания биогенных веществ в водоёмах пограничного буферного комплекса западной части Полистово-Ловатской болотной системы // Наука на службе территориальной охраны природы: эколого-просветительский и социальный аспекты : материалы научно-практического семинара, посвящённого 30-летию Полистовского государственного природного заповедника (16-17 августа 2024 года, р. п. Бежаницы). — КИРА Архангельск: 2024. — С. 49–53.
2. Тимофеев И. В., Никольская Л. В. Санитарно-химическое состояние некоторых родников г. Пскова и Псковского района в весенний период // Экология родного края: проблемы и пути их решения. — Т. 1. — Киров: Вятский государственный университет, 2024. — С. 153–157.

Патенты и регистрация ЭВМ:

1. Программное обеспечение «OncoFocus» №2024690606
   Дата регистрации: 16.12.2024 г.
   Колычёв Антон Евгеньевич, Корчевская Елена Алексеевна, Богатырёва Милана Руслановна, Тимофеев Илья Вячеславович

2023 год

Статьи в научных журналах:

1. Дрозденко Т. В., Тимофеев И. В. Развитие фитопланктона и качество воды устья реки Мирожки в весенне-летний период 2022 года // Вестник Псковского государственного университета. Серия: Естественные и физико-математические науки. — 2023. — Т. 16, № 2. — С. 78–87.

Тезисы докладов на конференциях:

1. Дрозденко Т. В., Тимофеев И. В. Видовая структура и экологические особенности фитопланктона озер Калацкое и Лесицкое (Псковская область, Печорский район) // Экология родного края: проблемы и пути их решения: материалы XVIII Всероссийской научно-практической конференции с международным участием. — Киров: Вятский государственный университет, 2023. — С. 209–214.
2. Тимофеев И. В., Веденеева Н. В. Определение основных загрязнителей 1 и 2 класса опасности Псковской области, аккумулированных в почве // Всероссийская научно-практическая конференция Экологический мониторинг опасных промышленных объектов: современные достижения, перспективы и обеспечение экологической безопасности населения. — Саратовский государственный технический университет им. Ю.А.Гагарина Саратов СГТУ имени Гагарина Ю.А: 2023. — С. 34–37.
3. Тимофеев И. В., Веденеева Н. В. Разработка рекомендаций по организации эколого-просветительских программ по обращению с опасными отходами различных возрастных групп населения с учётом их психофизиологических особенностей // Всероссийская научно-практическая конференция Экологический мониторинг опасных промышленных объектов: современные достижения, перспективы и обеспечение экологической безопасности населения. — Т. 1. — Саратовский государственный технический университет им. Ю.А.Гагарина Саратов СГТУ имени Гагарина Ю.А: 2023. — С. 249–251.
4. Дрозденко Т. В., Тимофеев И. В. Таксономический состав и эколого-географическая характеристика фитопланктона устья реки Великой // Экология речных бассейнов: Труды 11-й Междунар. науч.-практ. конф. / Под общ. ред. проф. Т.А. Трифоновой. — Владим. гос. ун-т. им. А.Г. и Н.Г. Столетовых Владимир Владимир: 2023. — С. 34–39.

2022 год

Статьи в научных журналах:

1. Изучение физической активности школьников / М. Ю. Галактионова, Н. В. Лисихина, Е. А. Алексеенко, Тимофеев И.В., Губайдулина Э.И. // Российский вестник перинатологии и педиатрии. — 2022. — Т. 67, № 4. — С. 176.
   EDN: SSNWGY
2. Дрозденко Т. В., Тимофеев И. В., Мишкова Т. А. Видовой состав и количественные показатели фитопланктона озёр Калацкое и Лесицкое (Псковская область, Печорский район) // Вестник Псковского государственного университета. Серия: Естественные и физико-математические науки. — 2022. — Т. 15, № 2. — С. 56–65.
3. Тимофеев И. В. Оценка адаптации детей к дошкольному образовательному учреждению // Российский педиатрический журнал. — 2022. — Т. 25, № 6. — С. 438–438.

Тезисы докладов на конференциях:

1. Дрозденко Т. В., Тимофеев И. В., Бугеро Н. В. Видовое разнообразие фитопланктона озер Калацкое и Лесицкое (Печорский район, Псковская область) // Эколого-биологические и географические исследования в решении региональных проблем. — Улан-Удэ: Бурятский государственный университет имени Доржи Банзарова, 2022. — С. 15–19.
2. Тимофеев И. В., Калинин И. Н. Оценка адаптации детей к дошкольному образовательному учреждению // Инновации в медицине и фармации 2022 : сборник материалов Международной научно-практической конференции студентов и молодых ученых. — Минск, Республика Беларусь: Белорусский государственный медицинский университет, 2022. — С. 699–701.
3. Калинин И. Н., Харлашова К. М., Тимофеев И. В. Роль медико-биологических и социальных факторов в формировании здоровья детей // Инновации в медицине и фармации 2022 : сборник материалов Международной научно-практической конференции студентов и молодых ученых. — Минск, Республика Беларусь: Белорусский государственный медицинский университет, 2022. — С. 623–625.

2021 год

Статьи в научных журналах:

1. Выявление токсического воздействия тяжёлых металлов на фитопланктон с помощью нейросетевого анализа индукционных кривых флуоресценции хлорофилла / С. С. Хрущев, Т. В. Дрозденко, Т. Ю. Плюснина, Тимофеев И.В., Тодоренко Д.А., Тихомирова Е.И., Антал Т.К. // Теоретическая и прикладная экология. — 2021. — № 2. — С. 134–141.
   https://doi.org/10.25750/1995-4301-2021-2-134-141 Q3
   

Научно-исследовательские работы и проекты